지난 6년동안 수백명의 악당들을 제거하며 갱들 사이에서는 공포의 대명사로 알려진 일명 ‘퍼니셔(응징자)’ 프랭크 캐슬의 새 계획은 악명높은 갱두목 가이타노 시저의 일당들을 소탕하는 일이다. 시저가 주최하는 파티에 침입한 프랭크는 조직원들을 모두 사살하는데, 그 가운데에 시저의 충복인 빌리 루소티가 큰 상처를 입고, 또한 조직원으로 잠복근무중이던 FBI 요원 페드가 프랭크에게 목숨을 잃는 일이 발생한다. 페드의 전 동료인 폴 버디안스키는 뉴욕경찰청에 ‘퍼니셔 추격팀(Punisher Task Force)’을 구성하여 프랭크의 뒤를 쫒는다. 또, 얼굴에 끔찍한 흉터를 가지게 된 루소티는 퍼니셔에게 복수를 맹세하고, ‘직쏘(Jigsaw)’라는 새로운 악당으로 변신, 흉악한 사이코 킬러들을 고용한다. 한편, 자신이 가장 싫어하는 악당의 모습으로 스스로가 변해가고 있음을 깨달은 프랭크는 ‘퍼니셔’로서의 생활을 청산하기로 결심한다. 하지만, 사망한 페드의 아내와 아이를 직쏘가 납치하자, 프랭크는 다시 총을 잡고 전쟁에 뛰어든다. 이제 사상최강의 적 직쏘를 상대로 한 프랭크의 목숨을 건 전투가 시작되는데…