두 개의 세계로 헤어져버린 엘릭 형제는 다시 만나기위한 수단을 강구한다. 형 에드는 세계대전의 전운이 감도는 격동의 서기 1923년 독일의 뮌헨으로 날아가버린 상태. 그곳에서 에드는 동생인 알과 너무나도 비슷하게 생긴 알폰스라는 청년을 만나 로켓공학의 힘으로 고향으로 돌아가려 한다. 그러나 좀처럼 일이 풀리지 않자 에드는 적응하기 힘든 이 세계에서 방황을 하게 된다. 그런 에드의 앞에 뜻밖의 형태로 길이 열린다. 어둠 속에 움직이는 존재, 즉 이상향 '샴발라'를 추구하는 사람들의 움직임이 그것이었다. 제 1차 세계대전에서 패한 충격으로 패닉상태가 된 뮌헨에서는 살인적인 인플레이션이 진행되고 불만을 품은 자들의 조직적인 움직임도 감지되는 상태였다. 그런 불온한 사회분위기 속에 토레라는 이름의 협회는 알폰소 일행의 로켓실험에 관심을 보인다. 하지만 그들의 목적은 바로 오컬트와 과학을 접목시켜 샴발라로 가는 길을 열어 배타적인 단일민족국가를 세우려는 것이었는데..