믹키 마우스, 도날드 덕, 데피 덕, 벅스 버니 등의 만화 캐릭터들은 자신들만의 거주지인 툰 타운에서 살고 있다. 영화의 시작은 1947년 마룬 스튜디오의 작품 <뭐가 타는데(Something's Cookin')>(Raoul J. Raout 감독)가 화면에 나타난다. 주인공인 로져 래빗은 위험한 부엌을 휘젓고 다니면서 찔리고, 구워지고, 감전되다가 결국 냉장고가 머리에 떨어지는데 그때 감독 조엘 실버(Joel Silver)이 "컷"하고 촬영을 중단시킨다. 로져가 대본을 잊어버리고 충격의 여파로 눈앞에 별이 오가는 대신 새들을 보았기 때문이다. 로져는 현재, 글래머 아내인 제시카가 그 지역 공장주인 마빈 애크미(Stubby Kaye)와 자주 만나는 사실로 인해 괴로와 하고 있다. 스튜디오 사장인 마룬은 술주정 뱅이 탐정 에디발리안트를 고용하여 로저로 하여금 제시카를 잊게 만들기 위해 제시카가 바람피우는 장면을 찍어오도록 만든다. 툰들이 사람들을 위해 공연하는 잉크와 페인트 클럽에서 에디는 제시카를 발견한다. 그녀는 마치 1940년대 영화계를 풍미했던 베로니카 레이크와 로렌 바콜을 합친듯한 모습의 만화 인물로서 낮은 목소리로 사람을 홀리는 노래를 부른다. 에디가 사진을 찍어 로저에게 보여주자 로져는 충격을 받고 잃어버린 사랑을 슬퍼하며 밤거리를 헤맨다. 에크미가 떨어진 금고에 깔려 살해당하자 로져는 제1의 용의자로 떠오른다. 검은 옷과 해골이 달린 지팡이를 짚은 둠 판사가 사건현장에 나타나 수사를 지휘한다. 그판사는 로져를 추적하여 그의 악명높은 툰 캐릭터 처형용 용액 딥을 이용하여 로져를 지워버리려 한다. 에디가 평소 툰들을 도와 주었던 명성을 아는 로져는 에디의 벽장침대속에 숨어들고 자신과 에디를 수감으로 묶고 만다. 둠과 그의 부하 족제비 들은 이두사람을 역전 바에서 마룬 스튜디오, 툰타운 등으로 끈질기게 추적하고 결국 마지막 대결이 에크미 공장에서 이루어진다. 비록 제시카가 무언가 속이는 듯한 위험한 여성처럼 보였지만 결국은 진정한 사랑을 가진 것으로 판명된다. 사건의 와중에서 에디는 둠 판사의 로스앤젤레스 고속도로 문화(무제한 도로, 간이식당, 광고판)를 향한 집착과 툰타운 파괴를 위한 음모를 밝혀낸다. 팅커 벨이 '끝'을 장식할 때 정의와 사랑이 승리한다.