사이보그와 인간이 공존하는 2029년,고도화된 기술로 지능화되고 흉포해지는 범죄에 대항하기 위해정부는 쿠사나기를 필두로 ‘공각기동대’를 조직한다 어느 날, 각국의 정보망으로부터 네트워크를 중심으로 출몰하며주가조작, 정보조작, 정치공작, 테러 등으로 국제수배중인 인물‘인형사’가 일본에 나타났다는 경고가 날아들고 정체불명의 해커 ’인형사’를 제거하기 위해쿠사나기는 임무에 뛰어드는데...